1959年 9月 中共山东省委宣传部批准，创办《山东海洋学院学报》，主编为赫崇本。
1959年10月《山东海洋学院学报》创刊号出版。
1960年 4月《山东海洋学院学报》1960年第1期发表了文圣常教授的论文“普遍风浪谱及其应用”和“涌浪谱”，受到国内外学术界的重视，后来被誉为“文氏谱”。
1962年11月 学校成立学报编辑部委员会（11人）。
主任委员: 许亮;副主任委员: 薛廷耀;主编: 赫崇本，
编委会委员：文圣常等9人。
1966年 1月《山东海洋学院学报》开始停刊。
1978年 6月《山东海洋学院学报》复刊。 组成新一届编辑委员会。
编委会主任:赫崇本；编委会副主任:方宗熙文圣常
编委会委员：王彬华等10人
1979年 5月 经国家科委批准，《山东海洋学院学报》对国内外发行。
1981年 3月 学报编委会调整。主任委员：赫崇本；副主任委员：方崇煕、文圣常、薛廷耀；编委会委员：冯士筰等23人。
1986年 6月《山东海洋学院学报》编辑室改为编辑部，刘安国任编辑部主任。
1988年 1月 经国家教委批准，山东海洋学院改名为青岛海洋大学。
1988年 9月《山东海洋学院学报》更名为《青岛海洋大学学报（自然科学版）》。组成自然科学版编辑委员会（第四届）。编委会主任：文圣常；
编委会副主任：李德尚、张正斌；主编：文圣常；副主编：刘安国；编委会委员：冯士筰等23人。
1992年12月《青岛海洋大学学报（自然科学版）》被评为国家教委直属高校优秀科技期刊。
1996年 4月《青岛海洋大学学报（自然科学版）》第四届编辑委员会成立。
编委会主任：文圣常；编委会副主任：管华诗、秦启仁、李德尚、张正斌、刘安国。主编：文圣常；副主编：刘安国；
编委会委员：王宁35人等。
1997年 1月 严国光任《青岛海洋大学学报（自然科学版）》编辑部主任，增补为常务副主编，第四届编委会副主任。
2001年 1月《青岛海洋大学学报（自然科学版）》改为双月刊。
2001年 2月 李凤岐任学报编辑部主任（兼）。
2001年10月 于卫任学报编辑部副主任（负责自然科学版）。
2004年 1月 青岛海洋大学学报（自然科学版）更名为中国海洋大学学报（自然科学版）。
2005年 4月 学报自然科学版成立第五届编委会.
编委会主任：管华诗；编委会副主任：冯士筰、李庆忠、吴德星、麦康森。主编：管华诗；常务副主编：于卫。
编委会委员：王宁等55人。
2005年 5月 鲍洪彤任学报编辑部主任。
2005年 8月 学报编辑部荣获“中国高等学校自然科学学报研究会“高校科技期刊先进集体”称号
2006年10月 学报荣获教育部科技司“首届中国高校精品科技期刊奖”。
2007年 7月 学报正式签署协议加盟科学出版社，2008年正式实施。
2008年11月 学报荣获教育部科技司“第二届中国高校精品科技期刊奖”。
2009年10月 25日学报创刊50周年庆典大会在鱼山校区举行。校党委书记于志刚、校长吴德星、学报主编管华诗、文圣常院士、中国高校学报研究会理事长颜帅等出席。
2010年 1月 学报由双月刊改为月刊。
2010年10月 学报获教育部科技司“第三届中国高校精品科技期刊奖”。
2011年 8月 学报第六届编委会成立。主编：冯士筰；常务副主编：刘秦玉；副主编：董双林、李华军、赵美训；编委会委员：包振民等56人。
2011年 9月 庞旻任学报自然科学版编辑部主任。
2012年11月 学报荣获教育部科技司“第四届中国高校精品科技期刊奖”。
2013年12月 学报荣获“2013中国国际影响力优秀学术期刊”。
2014年10月 学报获教育部科技司“第五届中国高校精品科技期刊奖”。
2014年12月 学报荣获“2014中国国际影响力优秀学术期刊”。
2015年 9月 学报荣获“2015期刊数字影响力100强（学术/科技类期刊）”。
2015年12月 学报荣获“2015中国国际影响力优秀学术期刊”。
2016年 9月 学报荣获“2016期刊数字影响力100强（学术/科技类期刊）”。
2016年10月 学报荣获中国高校科技期刊研究会“2016年度中国高校百佳科技期刊奖”。
2016年12月 学报荣获“2016中国国际影响力优秀学术期刊”。
学报获山东省高等学校学报研究会“山东省优秀科技期刊”奖
学报获中国高校科技期刊研究会“中国高校百佳科技期刊”。
2019年5月 学报自然版第七届编委会成立。主编：李华军；常务副主编：陈显尧，艾庆辉；编委会委员共计53人。
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